В 1993 году группа инициативных людей, выдающихся деятелей башкирской культуры и искусства, решила создать объединение для консолидации башкир, живущих в Челябинской области, а также для сохранения, развития и популяризации их духовных ценностей. Среди основателей были Харис Мунасипович Юсупов, создатель южноуральской школы дзюдо и отец последних двух председателей организации, Марселя и Мориса Юсуповых, и Урал Кофеевич Сафиуллин, первый редактор башкирской газеты «Уралым».

До 2007 года организация называлась «Челябинская областная общественная организация „Курултай (собрание) башкир Челябинской области“». Она была официально зарегистрирована 8 января 2003 года. В 2007 году произошло переименование в ЧООО «Башкирский Курултай», которое было зарегистрировано 17 мая того же года.

Организация является одним из соучредителей Ассамблеи народов Челябинской области.

Основные цели ЧООО «Башкирский Курултай»:

• Возрождение и сохранение национальной башкирской культуры.
• Защита законных прав и национально-культурных интересов её членов.

В соответствии с Уставом ЧООО «Башкирский Курултай»:

• Высшим руководящим органом является Конференция членов организации.
• Членами могут стать граждане, подавшие заявление о вступлении.
• Постоянно действующим руководящим органом является Исполком Курултая, избираемый Конференцией на три года. Состав Исполкома также определяет Конференция (в настоящее время в него входят 22 человека).
• Председателя Исполкома избирает Конференция.

По данным организации, на территории Челябинской области действует около 21 местного отделения, самые крупные из которых находятся в местах компактного проживания башкир: в Аргаяшском, Кунашакском, Красноармейском, Сосновском и Чебаркульском муниципальных районах, а также в городах Магнитогорск, Златоуст, Озёрск, Копейск и Верхний Уфалей.